Gần đây, quyền lực của văn phòng công tố đã bị nghi ngờ khi nhiều người bày tỏ sự phẫn nộ về nhiều vụ bê bối đã xảy ra trong văn phòng và mối quan hệ giữa văn phòng và các tập đoàn kinh doanh. Tổng thống Moon đã soạn thảo các cải cách truy tố để phân chia lại một số quyền lực được trao cho văn phòng công tố. Các cải cách sẽ trả lại một số quyền kiểm soát điều tra tội phạm cho các sĩ quan cảnh sát. Mục đích của việc này là phân phối quyền lực trong các cuộc điều tra tội phạm và ngăn chặn các công tố viên hành động thay mặt cho các tập đoàn kinh doanh. Một khía cạnh khác của cải cách là thành lập một lực lượng đặc nhiệm chuyên điều tra tham nhũng cấp cao.[17]Một vấn đề mà Moon gặp phải khi thực hiện các chính sách của mình là thăm dò Bộ trưởng Tư pháp mới được bổ nhiệm của ông, Cho Kuk vào năm 2019. Cho được giao trách nhiệm giám sát những cải cách này. Văn phòng công tố đã mở cuộc điều tra về gia đình Cho, đặc biệt là vợ và con gái của ông ta. Các nhà điều tra này phát hiện ra rằng con gái của Cho đã kiếm được từ địa vị của cha mình, điều này không được coi là gian lận mà chỉ là một sản phẩm của đặc quyền. Áp lực từ cuộc điều tra trở nên quá lớn khiến Cho cuối cùng phải từ chức chỉ sáu tuần sau đó. Số phận của những cải cách này nằm trong sự cân bằng giữa đảng dân chủ và đảng bảo thủ, những người đã ủng hộ văn phòng công tố. Tổng thống Moon đã tiếp tục đấu tranh để thực hiện những cải cách này. Vào tháng 1 năm 2020, Choo Mi-ae trở thành Bộ trưởng Tư pháp và làm việc cùng với Moon để hạn chế văn phòng công tố và thực hiện các cải cách thông qua cơ quan lập pháp.[18]